虽然纽特（埃迪·雷德梅恩EddieRedmayne饰）协助美国魔法部将邪恶的黑巫师格林德沃（约翰尼·德普JohnnyDepp饰）捉拿归案，但最终格林德沃还是逃脱了禁锢，他来到了法国巴黎，一是为了集结信徒掀起革命，二是为了寻找同样藏匿在这里的克雷登斯（埃兹拉·米勒EzraMiller饰），寄生在克雷登斯身上的默默然是帮助格林德沃实现野心的不可或缺的道具。格林德沃的潜逃在整个魔法世界里都掀起了轩然大波，一时间草木皆兵。邓布利多（裘德·洛JudeLaw饰）秘密的找到了纽特，希望他能够前往巴黎，先格林德沃一步找到克雷登斯。和纽特一起踏上巴黎之旅的，是麻鸡雅各布（丹·福格勒DanFogler饰），他此行的目的，是要找回先前因为吵架而来到巴黎投奔姐姐蒂娜（凯瑟琳·沃特森KatherineWaterston饰）的恋人奎妮（艾莉森·苏朵儿AlisonSudol饰）。

1927年，当美国魔法国会（MACUSA）将黑巫师 盖勒特·格林德沃移交给欧洲接受审判时，格林德沃逃脱了。三个月后，纽特·斯卡曼德在伦敦请求魔法部解除他的国际旅行禁令。在那里，他遇到了前霍格沃茨同学、他哥哥忒修斯的未婚妻莉塔·莱斯特兰奇。如果纽特同意帮助忒修斯找到在巴黎的克雷登斯·巴瑞波恩，魔法部将批准纽特的请求。纽特在得知他必须与无情的赏金猎人冈纳尔·格里姆森合作后拒绝了。阿不思·邓布利多（被揭露间接但故意将纽特送到纽约）还要求纽特找到克雷登斯，并相信克雷登斯是莱塔失散已久的同父异母兄弟乌鸦·莱斯特兰奇五世。

纽特的美国朋友奎妮·戈德斯坦和雅各布·科瓦尔斯基拜访了他，后者是一个不会魔法的人。雅各布恢复了去年被抹去的记忆。纽特得知奎妮的妹妹蒂娜·戈德斯坦错误地认为纽特和莉塔订婚了，并开始约会其他人。纽特意识到奎妮迷住了雅各布，并来到伦敦规避巫师与非魔法人士之间的婚姻禁令。纽特解除魔咒后，雅各布拒绝与奎妮结婚，担心她会面临后果。奎妮心烦意乱地离开去寻找正在巴黎寻找克雷登斯的蒂娜。纽特和雅各布紧随其后。

在巴黎，克雷登斯与被俘虏的表演者纳吉尼逃离了马戏团，纳吉尼是一个被诅咒永久变成蛇的女人。在寻找克雷登斯的生母时，他们找到了半精灵仆人伊尔玛·杜加德，后者将克雷登斯带到了美国收养。格里姆森是格林德沃的秘密追随者，在艾尔玛透露是谁派她来之前杀死了她。蒂娜遇到了也在追捕克雷登斯的优素福·卡马。纽特和雅各布追踪优素福找到蒂娜，发现她被扣为人质。优素福也囚禁了他们，并解释说他立下了牢不可破的誓言要杀死他同父异母的兄弟，他认为他就是克雷登斯。与此同时，心烦意乱的奎妮被带到格林德沃。了解奎妮的能力后，他允许她离开，同时通过她嫁给雅各布的愿望操纵她加入他。

纽特和蒂娜潜入法国魔法部寻找证实克莱登斯身份的文件，但被莱塔和忒修斯发现。纽特解释说他从未与莱塔订婚后，纽特和蒂娜重聚。他们前往莱斯特兰奇家族的坟墓，发现优素福正在与克莱登斯和纳吉尼对峙。优素福透露，他正在执行父亲穆斯塔法的要求，为母亲劳伦娜报仇：她被乌鸦·莱斯特兰奇四世用夺魂咒绑架了，并在生下优素福同父异母的妹妹莱塔时去世。乌鸦四世再婚并生下乌鸦五世。在发现优素福的复仇阴谋后，他将乌鸦五世送往美国收养，以保证他的安全。莉塔透露，她无意中导致了乌鸦五号的死亡：在航行到美国的途中，莉塔无法忍受乌鸦不断的哭泣，将她的小弟弟换成了另一个婴儿克莱登斯；船沉没了，乌鸦也淹死了。

一行人参加了格林德沃追随者的集会。雅各布正在寻找参加者之一的奎妮。格林德沃展示了未来全球战争的愿景，并反对禁止巫师阻止此类悲剧的法律。当忒修斯和傲罗包围集会时，格林德沃促使他的追随者将他的信息传播到整个欧洲。他召唤出一圈蓝色火环，杀死撤退的傲罗，只有他最忠诚的追随者才能安全穿越。奎妮和克雷登斯不顾雅各布和纳吉尼的抗议，穿越了火场，而莱塔牺牲了自己，让其他人逃脱。当格林德沃和他的追随者离开时，剩下的巫师和不朽的炼金术士尼古拉斯·勒梅扑灭了大火。纽特加入对抗格林德沃的战斗。

在霍格沃茨，纽特向邓布利多赠送了纽特的嗅嗅从格林德沃偷来的小瓶。它包含格林德沃和邓布利多年轻时签订的血契，防止他们互相决斗；邓布利多相信它可以被摧毁。在他的奥地利基地努门加德城堡，格林德沃向克莱登斯赠送了一根魔杖和他的凤凰，并透露了克莱登斯可能的身份：奥勒留·邓布利多。[6]